光合細菌施到土壤或者葉面后，可以有效地增加固氮菌、細菌、真菌、放線菌的數(shù)量，大大減少絲狀真菌的數(shù)量，因此可以提高土壤和葉面有效氮的含量，確保土壤中磷、鉀釋放，有利于作物對氮、磷、鉀的吸收，同時可促使土壤疏松，增強土壤的透氣性，并且土壤保水、保肥能力得到增強，土壤有機質得到快速分解，土壤熱量大大提高，因此土壤肥力可得到極大提高。
光合細菌在有光時，可以利用光能吸收二氧化碳進行光合作用；在無光、有氧條件下，可以利用小有機物的能量吸收二氧化碳進行光合作用。因此，在生產中我們可以利用光合細菌這個特點，在連續(xù)陰天時，用小有機物如紅糖與光合細菌結合噴灑作物，這樣就可保證作物有足夠的營養(yǎng)供給，維持作物正常生長。這一特性，在三七、石斛生產上已經得到廣泛運用和驗證。
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