1、管路阻塞
阻塞是管路的主要故障, 管路阻塞，壓力會突然升高，超壓。部分阻塞開始不明顯，不斷滯留在液流中的微粒壓力會慢慢升高，最后阻塞。管路阻塞同時會看到接頭或墊圈滲漏，低壓好一些，高壓滲漏明顯。
管路或部分阻塞是由下列原因引起的：
①沒有很好過濾流動相；
②樣品中有微粒；
③泵或進(jìn)樣器墊圈產(chǎn)生碎片；
④預(yù)柱、護(hù)柱和分析柱中漏出填料；
⑤毛刺和銼屑進(jìn)入；
⑥流動相中的結(jié)晶鹽；
⑦微生物
⑧系統(tǒng)中進(jìn)入了其它顆粒性物質(zhì)。
系統(tǒng)中管路阻塞的現(xiàn)象很少見，常見的是燒結(jié)過濾片（玻璃砂芯）阻塞。用燒結(jié)過濾器或過濾片（孔徑2-10um）能去掉阻塞管路的微粒（如0.25mm管徑）。
用系統(tǒng)分段法檢查阻塞的管路，從后向前分別松開接頭檢查，找到阻塞管路后，應(yīng)立即拆下來疏導(dǎo)或換新。
如果是非剛性物質(zhì)阻塞，如生物樣品中的生化物質(zhì)（蛋白質(zhì)）、微生物等，可用極細(xì)的金屬絲導(dǎo)通，也可以在火頭上燒一燒，使有機(jī)物炭化，而后再導(dǎo)通。
如果是剛性物質(zhì)阻塞，要導(dǎo)通則十分困難，采用反沖的辦法有時能成功。就是將管子調(diào)頭用泵沖洗。操作時要注意保護(hù)眼睛和裸露的皮膚，因阻塞物會以很高的速度沖出來。
無法導(dǎo)通的管路要換上同樣規(guī)格的管子。如果換上新管后又被阻塞，則應(yīng)該停機(jī)檢查上面提到的引起阻塞的幾種原因。
2、管頭損壞
管子切口不平整或密封卡套不平滑都不能密封。要重新切割去壞管頭（包括卡套），
調(diào)換新卡套，裝上接頭擠壓卡緊。
大多數(shù)滲漏是由接頭引起的，而不是管子問題。
3、接頭故障的預(yù)防與解決辦法
幾乎所有的接頭故障都是可以避免的，按下列要求可以有效地預(yù)防接頭的故障：
①使用儀器設(shè)計(jì)時的部件（如同一廠商的部件）；
②使用效果好的接頭部件（如零死體積，即樣品通過時V0=0）；
③按要求組裝和擰緊接頭，不可擰得過緊；
④避免接頭混淆使用，及時作好標(biāo)記；
⑤使用合格的工具。
組裝/拆卸接頭時要檢查在密封面上有無微粒和無機(jī)鹽晶體。這些污染物影響密封性
能，更嚴(yán)重的使螺絲咬死。
最后，旋緊接頭時用死扳手，保證不咬壞接頭。
平時要準(zhǔn)備一些要能用到的各種接頭備件。
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